På grund av hans traumatiska upplevelse av att möta The Ancients i det föregående spelet, har Mike fått ett sammanbrott. I Dark Seed 2 återvänder Mike till sin hemstad för att delta i sin gymnasieskolas återföreningsfest. Men efter ankomsten till staden börjar mystiska saker hända. Hans tidigare gymnasiekärlek blir mördad på återföreningskvällen och Mike blir plötsligt huvudmisstänkt. Sakta inser Mike att The Ancients är tillbaka för att spöka för honom igen. Dark Seed är utformat som ett klassiskt äventyrsspel med personinteraktion och pussel. Dark Seed 2 är fortsättningen på det första skräckspelet där Mike Dawson mötte de mystiska Ancients.
